اشتملت هذه الرسالة على مقدمة، وتمهيد، وأربعة فصول، وخاتمة، وفهارس.المقدمة: وتتضمن أهمية البحث، وأسباب اختياره، وأهدافه، وتساؤلات البحث، والدراسات السابقة، ومنهجه، ومنهج البحث والباحث، وخطة البحث.التمهيد وفيه: أهمية التفكير في الإسلام، ودوره، ومفهومه.الفصل الأول: بنية التفكير عند الشيخ محمد الأمين الشنقيطي.الفصل الثاني: مكانة التفكير عند الشيخ محمد الأمين الشنقيطي.الفصل الثالث: معالم منهجية التفكير عند الشيخ محمد الأمين الشنقيطي وتطبيقاتها المعاصرة.الفصل الرابع: سبل الاستفادة من دراسة منهجية التفكير عند الشيخ محمد الأمين الشنقيطي.الخاتمــة: وتشمل أهم نتائج البحث، والتوصيات، ثم الفهارس العامة للبحث.